ZapLineを用いたLFPに対する電源由来のアーティファクト除去 (Python)
ZapLineとは ZapLineはEEGやMEGなどのデータにおける電力系統 (power line)に由来するアーティファクトを除去するアルゴリズムである．アーティファクトの周波数を指定し（残念ながら指定が必要），アーティファクト成分のみを除去する時空間的フィルタを求めることを目的....
Tensorpacによる位相-振幅カップリング (PAC) 推定
周波数間カップリング (CFC) について 近接する神経細胞の集団活動によって生じる電位変化を電場電位(field potential) といい，脳波計(EEG), 皮質脳波(ECoG), 脳磁図(MEG)等で計測できる．細胞集団の同期した活動は様々な周波数の振動として計測される．その周波数が....
非負値行列因子分解(NMF)を用いたグリッドパターンの創発
内側嗅内皮質(MEC)にあるグリッド細胞 (grid cells) は六角形格子状の発火パターンにより自己位置等を符号化するのに貢献している．この発火パターンを生み出すモデルは多数あるが，その中でもシンプルなのが(Dordek et al., eLife, 2016)である．場所細胞(plac....
【勉強会資料 2020 第8回】 視覚とSparse coding
2020.08.21に行われた第8回勉強会のオンライン勉強会の資料を公開します。視覚生理学の基礎と第一次視覚野(V1)のモデルであるSparse codingモデル (Olshausen & Field, 1996) の説明を行いました。Sparse codingモデルをPythonで....
