CodeQUEEN2024
CodeQUEEN2024 決勝戦に参加してきました！ CodeQUEENとは kenkooooさん主催の、女性向け競技プログラミングコンテストです。 女性の競技プログラマーが少ないことを受けて開催されています。 予選が6月に行われ、参加者のうち高校生、大学生・大学院生、社会人それぞれ上位....
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（記事中の意見やお勧めなどは原則としてそれぞれの執筆者個人のものであり、会としての見解を示すものではありません。）
single cell解析における遺伝子発現量の可視化
目的 scanpyでsingle cellの解析を行う際、遺伝子の発現量を見るとき、sc.pl.stacked_violinを用いて、以下の画像のように細胞タイプごとのさまざまな遺伝子の発現量の比較が可能です。 普段、研究室に所属して研究に協力させていただいてるのですが、研究室で「特定....
5年次研究留学 @ ハーバード大学
概要 阪大医学部のカリキュラムでは、5年生の1~2月に臨床研究室配属期間があります。 その期間を利用してアメリカのハーバード大学へ1ヶ月間の研究留学をしたので、その活動内容について報告します。 自分はMD-PhDコースに入っておらず、周りに研究留学に行った人もいなかったため、留学先の選....
MatterGPT: Mattermostで動作するChatGPT連携チャットボット
本会での利用のために新たに開発したMatterGPTは、OpenAIのChatGPTと連携し、Mattermost上での会話をサポートするチャットボットです。 このボットを活用することで、自然言語の形式で質問やコメントを行うことが可能となります。 特筆すべき点として、MatterGP....
医療画像と自己教師あり学習まとめ
休み中に読んだ自己教師あり学習の医療画像への応用について３つまとめました。 APTOS2019で検証するときはkaggle上でsubmitしてスコアを出してほしいなと個人的には思いました。 画像に紐付いた別データ(テキストや遺伝子データなど)を使ってマルチモーダルな学習をするのは今後....
統計検定準1級 合格体験記
2022年7月9日にCBT方式で統計検定準1級に合格したので、合格体験記を残します。 あくまでも合格体験記なので、合格のためのコツなどはあまり紹介しません。 統計検定を受けた目的や自分が行った対策、合格後の感想などを中心に書いていこうと思うので、受験するきっかけになれば幸いです。 著者....
非可換ゲージ理論の頂点計算機
非可換ゲージ理論の頂点計算をする．添字は全て下に付ける仕様．
境界条件を伴うカーネル密度推定
WSI＊自己教師あり学習のメモ
最近病理の画像をバイトで扱うことが増えています。せっかくなので自己教師あり学習を使ってみたいと思い、病理画像に自己教師あり学習を用いた論文をいくつか調べました。 WSIとは Whole slide images（WSI）とは、バーチャルスライドとも呼ばれる病理組織プレパラート標本全体をス....
英語のカルテデータのコンペに参加してみた(際の失敗と反省)
この記事の趣旨 医学生かつ技術がある程度わかる人としてkaggleに関わる機会を得た。 その経験を通して学んだことなど今から書く。臨床を学んだ医師がコーディング以外の強みを活かしてテクノロジーに関わっていくとはどういった形のものなのか、イメージがつくようになってもらえたら嬉しい。なお....
