大阪大学医学部 Python会 (情報医科学研究会)

Now is better than never.

技術ブログ

Research tools & topics    tags:Research tools & topics

Programming    tags:Programming

その他    tags:その他


(記事中の意見やお勧めなどは原則としてそれぞれの執筆者個人のものであり、会としての見解を示すものではありません。)

統計検定準1級 合格体験記

2022-09-17(Sat) - Posted by 池側 in 技術ブログ    tag:検定試験 tag:Statistics

2022年7月9日にCBT方式で統計検定準1級に合格したので、合格体験記を残します。 あくまでも合格体験記なので、合格のためのコツなどはあまり紹介しません。 統計検定を受けた目的や自分が行った対策、合格後の感想などを中心に書いていこうと思うので、受験するきっかけになれば幸いです。 著者....

Read more...



境界条件を伴うカーネル密度推定

2022-08-09(Tue) - Posted by 山本 in 技術ブログ    tag:Python

カーネル密度推定と境界 カーネル密度推定 (kernel density estimation; KDE) はカーネル関数を用いてデータの確率密度関数を推定する手法である.Pythonの場合はscipy.stats.gaussian_kdeを使うのが主である.この記事では境界条件があるときに....

Read more...


WSI*自己教師あり学習のメモ

2022-07-03(Sun) - Posted by 安部 in 技術ブログ    tag:Machine Learning tag:論文まとめ

最近病理の画像をバイトで扱うことが増えています。せっかくなので自己教師あり学習を使ってみたいと思い、病理画像に自己教師あり学習を用いた論文をいくつか調べました。 WSIとは Whole slide images(WSI)とは、バーチャルスライドとも呼ばれる病理組織プレパラート標本全体をス....

Read more...


英語のカルテデータのコンペに参加してみた(際の失敗と反省)

2022-06-10(Fri) - Posted by 杉原 in 技術ブログ    tag:Data Science Competition

この記事の趣旨 医学生かつ技術がある程度わかる人としてkaggleに関わる機会を得た。 その経験を通して学んだことなど今から書く。臨床を学んだ医師がコーディング以外の強みを活かしてテクノロジーに関わっていくとはどういった形のものなのか、イメージがつくようになってもらえたら嬉しい。なお....

Read more...


CLIPを実装し理解する

2022-05-24(Tue) - Posted by 池側 in 技術ブログ    tag:Machine Learning

目的 CLIPを理解するため、公式実装や他の記事を参考にしながらCLIPを自分で実装してみました。 公式実装では他に様々な工夫がなされていますが、今回は最低限のコードでCLIPを分かり易く実装することを目的にしているため、性能については保証できません。 本記事はCLIPの実装と解説を主....

Read more...


ZapLineを用いたLFPに対する電源由来のアーティファクト除去 (Python)

2022-05-21(Sat) - Posted by 山本 in 技術ブログ    tag:Python tag:Neuroscience

ZapLineとは ZapLineはEEGやMEGなどのデータにおける電力系統 (power line)に由来するアーティファクトを除去するアルゴリズムである.アーティファクトの周波数を指定し(残念ながら指定が必要),アーティファクト成分のみを除去する時空間的フィルタを求めることを目的....

Read more...