プレゼン形式の動画からスライドのpdfを自動作成する＋OCRをつける
昨年度はずっとオンラインの授業であったため、それに役立つようなプログラムを作ったりしていました。 中でも、 「プレゼン形式の動画からスライドのpdfを自動作成する＋OCRをつける」 はかなり役立っています。 zoomなどで授業がある際、教員によってはレジュメを配ってくれない場合もあります....
シェルコマンドに触れてみよう
シェルって？ コマンドってなに？ 詳しくはググるなり下の記事等を見てもらえばよいのですが、 簡単にまとめると - コマンド：マウスやトラックパッドを用いて操作するのではなく、キーボードでコンピュータに命令を与えるもの - シェル：命令をコンピュータに伝えるプログラムのこと つまるところ、Pyth....
がんゲノム変異シグネチャー解析
がんゲノムの変異シグネチャーの推定にチャレンジしてみました。 きっかけ 先日の遺伝学の講義にて、がんゲノムの変異シグネチャーを教えていただき、やり方も詳しく書かれていたので、挑戦してみました。 講義ではRでしたので、Pythonでも同じ結果が得られるか、Pythonの勉強も兼ねての挑戦....
阪医Python会特製 RNA-seq pipeline ver. 1.0 リリース
阪医Python会のbioinformaticsチームの一つの成果として、RNA-seqのパイプラインのv1.0がリリースとなったので記事とさせていただきます。SRR idから遺伝子✕サンプルのテーブルにするまでには意外に大変ですが、それをすべて自動化しました。ダウンロード、詳細等....
