線形混合効果モデル
経時測定データ解析 複数の対象者に対して、ある反応変数を時間の経過とともに繰り返し測定したデータを、経時測定データ（longitudinal data）という。経済学分野では、パネルデータ解析として知られている。 経時測定データ解析の特徴 個体間誤差だけでなく、個体内誤差も考慮する必要が....
技術ブログ
Neural Tangentsによる無限幅深層ニューラルネットワークの構築とベイズ推論
要点 Neural TangentsはGoogle AIが開発したJAXのラッパーライブラリです。無限幅 (中間層のユニット数$\to \infty$)のニューラルネットワーク (以後, NN: neural networks)を高速かつ簡単に構築及び学習させることを目的としています。 Neural....
ICA（独立成分分析）について
UNIX系OSのファイルアクセス権
Python会が管理する医学科学生用計算サーバ (以下、医学科計算サーバ) が本格的に使える状態に (ほぼ) なりました。 OS は Ubuntu 18.04 LTS です。 計算サーバのようにUNIX系OSをマルチユーザで使う場合、ファイルの所有権／アクセス権の理解が必須です。 本稿ではその基本と、そ....
シェルコマンドに触れてみよう
シェルって？ コマンドってなに？ 詳しくはググるなり下の記事等を見てもらえばよいのですが、 簡単にまとめると - コマンド：マウスやトラックパッドを用いて操作するのではなく、キーボードでコンピュータに命令を与えるもの - シェル：命令をコンピュータに伝えるプログラムのこと つまるところ、Pyth....
deeplabcutの使い方まとめ
DeepLabCut とは deeplabcutは、動物の行動実験などに使える動画のトラッキングツールです。 package化されているので簡単に使うことができます。 googlecolabでもできるそうです。 詳しい使い方は下記の資料が参考になります。 日本語資料： https://qiit....
バイオインフォマティクス技術者認定試験2019 解答速報？
先日受験したバイオインフォマティクス認定試験をあらためて復習して、ついでに解答速報（全然速くない）と備忘録程度の解説を書きました。 模範解答 (?) 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 0 4 4 3 3 2 2 4 1 2 2 10 2 1 3 3 4 2 4 3 1 3 20 3 4 2 2 4 1 2 1 4 3 30 1 1 1 2 1 2 3 4 1 4 40 3 4 4 3 2 2 3 1 ....
水色コーダー vs 応用情報技術者試験
国家試験 情報処理技術者試験は、IPA/経産省による国家試験です。 いわゆる国試です。 情報処理技術者試験のうち、分野を限定しない一般的な試験には基本情報技術者試験（レベル2）と応用情報技術者試験（レベル3）の2種類があります。 試験は春秋の年2回。 春に選んだのは前者でしたが正直イマイチ....
機械学習のための最新GPU比較
某所でGPU調達の必要があって、いまどきの事情を調べました。 ゲームのことは知りません。 主要GPU一覧 NVidia製Volta/Turing世代ハイエンドデスクトップ／ワークステーション用の主要GPUラインアップ。 コア VRAM 最大精度 TDP 放熱 価格(税込) GeForce RTX 208....
試験 vs Python
クイズ丸暗記選手権 あさっては某科目の試験です。 クイズみたいな過去問をそのまま出すから理屈抜きで丸暗記しろという、哲学的な出題だそうです。 そして僕は諸事情によりまったく勉強してできていなかったので、何とかしないといけません。 僕が悪いんじゃない世のなかが悪いんだ。 こういうときは、もう....
