大阪大学医学部 Python会 (情報医科学研究会)

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技術ブログ

基礎配属と企業インターン

2019-07-14(Sun) - Posted by 小川 in 技術ブログ    tag:企業インターン

概要 来年以降に基礎配属の1-2年生向けです。 基礎配属を利用して中期の企業インターンに行く、という多分そんなに例のないことを試みているので、参考までに。 要はいろいろ可能性があるので前例に縛られずに考えてみると良い、ということです。 夏季休暇・基礎配属の予定 8月・9月:Preferre....

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転移学習とCAM

2019-06-28(Fri) - Posted by 味岡 in 技術ブログ    tag:Machine Learning

こんにちは。神大の味岡です。一年くらい前 (編注: 原記事が執筆された2019年6月頃のこと) にdeep learningを使用した画像分類をしていたので、それについて書きたいと思います。サンプルとして、Kaggleのdog vs catを用いました。 とてもありがちな内容で恐縮ですがよろし....

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AtCoder Beginners Selection 雑感

2019-06-24(Mon) - Posted by 加藤 in 技術ブログ    tag:競技プログラミング

プログラミング初心者の加藤です。勉強会の時に、とりあえずやってみたらいいよと言われたので、よく分からないままやってみました。その概要と雑感です。 AtCoderとは? まず始めにAtCoderの説明から。AtCoderとは、オンライン上で競技プログラミングのコンテストを提供しているサ....

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がんゲノム変異シグネチャー解析

2019-06-21(Fri) - Posted by 山田 in 技術ブログ    tag:Bioinformatics

がんゲノムの変異シグネチャーの推定にチャレンジしてみました。 きっかけ 先日の遺伝学の講義にて、がんゲノムの変異シグネチャーを教えていただき、やり方も詳しく書かれていたので、挑戦してみました。 講義ではRでしたので、Pythonでも同じ結果が得られるか、Pythonの勉強も兼ねての挑戦....

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行列演算の初歩の初歩とNumPy

2019-05-16(Thu) - Posted by 小川 in 技術ブログ    tag:Python

機械学習をはじめ、何をやるにも行列演算は必須です。 本稿ではその初歩と、ライブラリ NumPy での基本的な実行方法を簡単に解説します。 (主に1年生向け。) 引用表記の部分 はやや発展的な内容なので、初めて読むときは飛ばしてOKです。 ベクトルの積 定義 まず、ベクトルの積を以下のように定義しま....

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Graph Neural Network (GNN)をゼロから実装した話

2019-05-13(Mon) - Posted by 小川 in 技術ブログ    tag:Machine Learning tag:企業インターン

医学科3年の小川です。 最近どうも某ネトゲの話しかしていない気がするので、たまには少し違う話題。 某社の試験課題 その筋で有名な某社の某イベント[注1]に応募したところ、選抜試験として次の課題が送られてきました。 Graph Neural Network (GNN)を言語標準ライブラリのみで実....

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IPA「基本情報技術者試験」受験録

2019-05-12(Sun) - Posted by 小川 in 技術ブログ    tag:検定試験

IPAの「基本情報技術者試験」 (2019年春期) を受験してきました。 なんでも経済産業省管轄の国家試験で、官報公示までされるらしい。よくわからないけどすごい。 厚生労働省の某国家試験は受験資格が残念ながらまだないけれど、こないだ国試受けてきたって言ってもたぶん嘘じゃないわけです。だか....

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U-Netで細胞認識

2019-05-01(Wed) - Posted by 味岡 in 技術ブログ    tag:Machine Learning

神大の味岡です。 今回は、deep learningの中でも画像から物体の領域を検出する「セマンティックセグメンテーション」といわれる手法についてです。 医療系の画像では、U-Netといわれるネットワークが有名です。 U-Netの特徴は? (U-Netの処理の概要、https://lmb.....

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はじめての競プロ:入力アンチョコメモ

2019-04-27(Sat) - Posted by 小川 in 技術ブログ    tag:競技プログラミング

入力のパターン Python会競プロ部(?)へようこそ! はじめての方には入力が最初の鬼門だと思います。 AtCoder のABCで、これさえ覚えれば大丈夫!な入力パターンは以下の通り。 最初は説明の意味がわからなくても、とりあえずコピペすれば動きます(何)。 言語は Python3 (3.4.....

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